موضوع اصلی این مجموعه، روایت بیش از یک قرن حضور پرتغالی‌ها در هرمز و ظلم فرماندهان آنان نسبت به مردم بومی است. داستان با ورود شاه عباس صفوی و اعزام امام‌قلی‌خان برای آزادسازی سواحل جنوبی ایران شکل تازه‌ای به خود می‌گیرد. قهرمان روایت، جوانی به نام هرمز است که در مسیر مبارزه با اشغالگران نقشی اثرگذار ایفا می‌کند.
فیلم‌نامه «نبرد هرمز» با رویکردی پژوهش‌محور و تأکید بر عبرت‌های تاریخی در حال بازنویسی است تا برخی مفاهیم مقاومت و پایداری را با اتفاقات روز هم‌خوان کند.